CONFLIST CUA        CUABK CUA01 CUA+1 

NATOM    CUABK      0
NATOM    CUA01      32
NATOM    CUA+1      32

IATOM    CUA01 CU1  0
IATOM    CUA01 CU2  1
IATOM    CUA01 aCB  2
IATOM    CUA01 aHB1 3
IATOM    CUA01 aHB2 4
IATOM    CUA01 aCG  5
IATOM    CUA01 aND1 6
IATOM    CUA01 aCE1 7
IATOM    CUA01 aHE1 8
IATOM    CUA01 aNE2 9
IATOM    CUA01 aHE2 10
IATOM    CUA01 aCD2 11
IATOM    CUA01 aHD2 12
IATOM    CUA01 bCB  13
IATOM    CUA01 bHB1 14
IATOM    CUA01 bHB2 15
IATOM    CUA01 bCG  16
IATOM    CUA01 bND1 17
IATOM    CUA01 bCE1 18
IATOM    CUA01 bHE1 19
IATOM    CUA01 bNE2 20
IATOM    CUA01 bHE2 21
IATOM    CUA01 bCD2 22
IATOM    CUA01 bHD2 23
IATOM    CUA01 cCB  24
IATOM    CUA01 cHB1 25
IATOM    CUA01 cHB2 26
IATOM    CUA01 cSG  27
IATOM    CUA01 dCB  28
IATOM    CUA01 dHB1 29
IATOM    CUA01 dHB2 30
IATOM    CUA01 dSG  31
IATOM    CUA+1 CU1  0
IATOM    CUA+1 CU2  1
IATOM    CUA+1 aCB  2
IATOM    CUA+1 aHB1 3
IATOM    CUA+1 aHB2 4
IATOM    CUA+1 aCG  5
IATOM    CUA+1 aND1 6
IATOM    CUA+1 aCE1 7
IATOM    CUA+1 aHE1 8
IATOM    CUA+1 aNE2 9
IATOM    CUA+1 aHE2 10
IATOM    CUA+1 aCD2 11
IATOM    CUA+1 aHD2 12
IATOM    CUA+1 bCB  13
IATOM    CUA+1 bHB1 14
IATOM    CUA+1 bHB2 15
IATOM    CUA+1 bCG  16
IATOM    CUA+1 bND1 17
IATOM    CUA+1 bCE1 18
IATOM    CUA+1 bHE1 19
IATOM    CUA+1 bNE2 20
IATOM    CUA+1 bHE2 21
IATOM    CUA+1 bCD2 22
IATOM    CUA+1 bHD2 23
IATOM    CUA+1 cCB  24
IATOM    CUA+1 cHB1 25
IATOM    CUA+1 cHB2 26
IATOM    CUA+1 cSG  27
IATOM    CUA+1 dCB  28
IATOM    CUA+1 dHB1 29
IATOM    CUA+1 dHB2 30
IATOM    CUA+1 dSG  31

ATOMNAME CUA01    0 CU1 
ATOMNAME CUA01    1 CU2 
ATOMNAME CUA01    2 aCB 
ATOMNAME CUA01    3 aHB1
ATOMNAME CUA01    4 aHB2
ATOMNAME CUA01    5 aCG 
ATOMNAME CUA01    6 aND1
ATOMNAME CUA01    7 aCE1
ATOMNAME CUA01    8 aHE1
ATOMNAME CUA01    9 aNE2
ATOMNAME CUA01   10 aHE2
ATOMNAME CUA01   11 aCD2
ATOMNAME CUA01   12 aHD2
ATOMNAME CUA01   13 bCB 
ATOMNAME CUA01   14 bHB1
ATOMNAME CUA01   15 bHB2
ATOMNAME CUA01   16 bCG 
ATOMNAME CUA01   17 bND1
ATOMNAME CUA01   18 bCE1
ATOMNAME CUA01   19 bHE1
ATOMNAME CUA01   20 bNE2
ATOMNAME CUA01   21 bHE2
ATOMNAME CUA01   22 bCD2
ATOMNAME CUA01   23 bHD2
ATOMNAME CUA01   24 cCB 
ATOMNAME CUA01   25 cHB1
ATOMNAME CUA01   26 cHB2
ATOMNAME CUA01   27 cSG 
ATOMNAME CUA01   28 dCB 
ATOMNAME CUA01   29 dHB1
ATOMNAME CUA01   30 dHB2
ATOMNAME CUA01   31 dSG 
ATOMNAME CUA+1    0 CU1 
ATOMNAME CUA+1    1 CU2 
ATOMNAME CUA+1    2 aCB 
ATOMNAME CUA+1    3 aHB1
ATOMNAME CUA+1    4 aHB2
ATOMNAME CUA+1    5 aCG 
ATOMNAME CUA+1    6 aND1
ATOMNAME CUA+1    7 aCE1
ATOMNAME CUA+1    8 aHE1
ATOMNAME CUA+1    9 aNE2
ATOMNAME CUA+1   10 aHE2
ATOMNAME CUA+1   11 aCD2
ATOMNAME CUA+1   12 aHD2
ATOMNAME CUA+1   13 bCB 
ATOMNAME CUA+1   14 bHB1
ATOMNAME CUA+1   15 bHB2
ATOMNAME CUA+1   16 bCG 
ATOMNAME CUA+1   17 bND1
ATOMNAME CUA+1   18 bCE1
ATOMNAME CUA+1   19 bHE1
ATOMNAME CUA+1   20 bNE2
ATOMNAME CUA+1   21 bHE2
ATOMNAME CUA+1   22 bCD2
ATOMNAME CUA+1   23 bHD2
ATOMNAME CUA+1   24 cCB 
ATOMNAME CUA+1   25 cHB1
ATOMNAME CUA+1   26 cHB2
ATOMNAME CUA+1   27 cSG 
ATOMNAME CUA+1   28 dCB 
ATOMNAME CUA+1   29 dHB1
ATOMNAME CUA+1   30 dHB2
ATOMNAME CUA+1   31 dSG 

#1.Basic Conformer Information: name, pka, em, rxn.
#23456789A123456789B123456789C
PROTON   CUA01      0
PROTON   CUA+1      0
ELECTRON CUA01      0
ELECTRON CUA+1      -1
EM       CUA01      0.
EM       CUA+1      264.
RXN      CUA01      -3.01 # 1/2 of existing value
RXN      CUA+1      -6.23 # 1/2 of existing value

CONNECT  CUA01 CU1  ion       0    CU2  0    aND1 0    cSG  0    dSG
CONNECT  CUA01 CU2  ion       0    CU1  0    bND1 0    cSG  0    dSG
CONNECT  CUA01 aCB  sp3       LIG   CA  0    aCG  0    aHB1 0    aHB2
CONNECT  CUA01 aHB1 s         0    aCB
CONNECT  CUA01 aHB2 s         0    aCB
CONNECT  CUA01 aCG  sp2       0    aCB  0    aND1 0    aCD2
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CONNECT  CUA01 aCE1 sp2       0    aND1 0    aNE2 0    aHE1
CONNECT  CUA01 aHE1 s         0    aCE1
CONNECT  CUA01 aNE2 sp2       0    aCE1 0    aCD2 0    aHE2
CONNECT  CUA01 aHE2 s         0    aNE2
CONNECT  CUA01 aCD2 sp2       0    aNE2 0    aCG  0    aHD2
CONNECT  CUA01 aHD2 s         0    aCD2
CONNECT  CUA01 bCB  sp3       LIG   CA  0    bCG  0    bHB1 0    bHB2
CONNECT  CUA01 bHB1 s         0    bCB
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CONNECT  CUA01 bCG  sp2       0    bCB  0    bND1 0    bCD2
CONNECT  CUA01 bND1 sp2       0    CU2  0    bCG  0    bCE1
CONNECT  CUA01 bCE1 sp2       0    bND1 0    bNE2 0    bHE1
CONNECT  CUA01 bHE1 s         0    bCE1
CONNECT  CUA01 bNE2 sp2       0    bCE1 0    bCD2 0    bHE2
CONNECT  CUA01 bHE2 s         0    bNE2
CONNECT  CUA01 bCD2 sp2       0    bNE2 0    bCG  0    bHD2
CONNECT  CUA01 bHD2 s         0    bCD2
CONNECT  CUA01 cCB  sp3       LIG   CA  0    cSG  0    cHB1 0    cHB2
CONNECT  CUA01 cHB1 s         0    cCB
CONNECT  CUA01 cHB2 s         0    cCB
CONNECT  CUA01 cSG  sp2       0    cCB  0    CU1  0    CU2
CONNECT  CUA01 dCB  sp3       LIG   CA  0    dSG  0    dHB1 0    dHB2
CONNECT  CUA01 dHB1 s         0    dCB
CONNECT  CUA01 dHB2 s         0    dCB
CONNECT  CUA01 dSG  sp2       0    dCB  0    CU1  0    CU2

CONNECT  CUA+1 CU1  ion       0    CU2  0    aND1 0    cSG  0    dSG
CONNECT  CUA+1 CU2  ion       0    CU1  0    bND1 0    cSG  0    dSG
CONNECT  CUA+1 aCB  sp3       LIG   CA  0    aCG  0    aHB1 0    aHB2
CONNECT  CUA+1 aHB1 s         0    aCB
CONNECT  CUA+1 aHB2 s         0    aCB
CONNECT  CUA+1 aCG  sp2       0    aCB  0    aND1 0    aCD2
CONNECT  CUA+1 aND1 sp2       0    CU1  0    aCG  0    aCE1
CONNECT  CUA+1 aCE1 sp2       0    aND1 0    aNE2 0    aHE1
CONNECT  CUA+1 aHE1 s         0    aCE1
CONNECT  CUA+1 aNE2 sp2       0    aCE1 0    aCD2 0    aHE2
CONNECT  CUA+1 aHE2 s         0    aNE2
CONNECT  CUA+1 aCD2 sp2       0    aNE2 0    aCG  0    aHD2
CONNECT  CUA+1 aHD2 s         0    aCD2
CONNECT  CUA+1 bCB  sp3       LIG   CA  0    bCG  0    bHB1 0    bHB2
CONNECT  CUA+1 bHB1 s         0    bCB
CONNECT  CUA+1 bHB2 s         0    bCB
CONNECT  CUA+1 bCG  sp2       0    bCB  0    bND1 0    bCD2
CONNECT  CUA+1 bND1 sp2       0    CU2  0    bCG  0    bCE1
CONNECT  CUA+1 bCE1 sp2       0    bND1 0    bNE2 0    bHE1
CONNECT  CUA+1 bHE1 s         0    bCE1
CONNECT  CUA+1 bNE2 sp2       0    bCE1 0    bCD2 0    bHE2
CONNECT  CUA+1 bHE2 s         0    bNE2
CONNECT  CUA+1 bCD2 sp2       0    bNE2 0    bCG  0    bHD2
CONNECT  CUA+1 bHD2 s         0    bCD2
CONNECT  CUA+1 cCB  sp3       LIG   CA  0    cSG  0    cHB1 0    cHB2
CONNECT  CUA+1 cHB1 s         0    cCB
CONNECT  CUA+1 cHB2 s         0    cCB
CONNECT  CUA+1 cSG  sp2       0    cCB  0    CU1  0    CU2
CONNECT  CUA+1 dCB  sp3       LIG   CA  0    dSG  0    dHB1 0    dHB2
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CONNECT  CUA+1 dHB2 s         0    dCB
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CHARGE   CUA01 aHB2     0.067
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CHARGE   CUA01 bHB1     0.067
CHARGE   CUA01 bHB2     0.067
CHARGE   CUA01 bCG     0.388
CHARGE   CUA01 bND1    -0.341
CHARGE   CUA01 bCE1    -0.012
CHARGE   CUA01 bHE1     0.148
CHARGE   CUA01 bNE2    -0.115
CHARGE   CUA01 bHE2     0.298
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CHARGE   CUA+1 bNE2    -0.229
CHARGE   CUA+1 bHE2     0.344
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